Mackenheim est inondé lors de la terrible crue du Rhin du 18 septembre 1852. Le fleuve s'élève alors à plus de 1,50 m au-dessus de ses berges, emportant 19 maisons. Il y a même de l'eau jusque sur l'autel de l'église. La résistance des digues du canal du Rhône au Rhin évite que la catastrophe ne s'étende plus à l'ouest, et la crue perd de son intensité au-delà de Strasbourg. Des dons provenant de toute l’Alsace permettent de reconstruire 14 maisons (quartier dénommé "Wasserhissle"). Pour commémorer ces hautes eaux, une stèle se dresse aujourd'hui dans la cité Napoléon III.